Secuenciación de nueva generación en falla medular pediátrica: una herramienta valiosa para un diagnóstico preciso

Resumen

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Los síndromes hereditarios de falla medular representan aproximadamente el 25% de los casos de anemia aplásica en la población pediátrica. Las tecnologías de Secuenciación de Nueva Generación (NGS) han permitido el diagnóstico de un número cada vez mayor de etiologías hereditarias de falla medular.

Objetivo: Determinar el rendimiento y la concordancia clínica de la NGS en el diagnóstico de una cohorte de pacientes con falla medular.

Pacientes y Método: Se incluyeron pacientes entre 0 y 17 años con diagnóstico de Síndrome de Falla Medular de acuerdo con los códigos de la clasificación CIE-10, a quienes se les hubiera realizado estudio genético entre 2018 y 2022. La información fue obtenida a partir del sistema de historias clínicas electrónicas. Se aisló ADN genómico y se cuantificó a través del fluorómetro Qubit®3.0. Las regiones de interés fueron seleccionadas utilizando una sonda de hibridización que incluía las regiones intrónicas y exónicas adyacentes a los genes incluidos en el panel. Se realizó amplificación clonal y secuenciación de extremos apareados de las regiones seleccionadas a través de la plataforma Illumina MiSeq. El análisis bioinformático se realizó en alineamiento con el genoma de referencia (GRCh38). Las variantes clasificadas como probablemente patogénicas o patogénicas fueron confirmadas a través de secuenciación Sanger.

Resultados: De los 18 pacientes incluidos, se encontró un diagnóstico genético a través de NGS en 5 (27,8%): dos casos de anemia de Fanconi, dos casos de Disqueratosis Congénita y un caso de falla medular asociada a una variante patogénica en el gen TP53. La concordancia clínica fue del 100%. Se encontraron dos variantes no reportadas en los genes FANCA y PARN como causantes de enfermedad.

Conclusiones: El uso de NGS en pacientes con falla medular identificó la etiología de cerca de un tercio de los pacientes de nuestra cohorte, con mayor rendimiento en los pacientes con diagnóstico clínico claro y otras características sindrómicas.

Pacheco-Orozco R, Devia A, Manzi E, Franco A, Pachajoa H, Medina Valencia D . Secuenciación de nueva generación en falla medular pediátrica: una herramienta valiosa para un diagnóstico preciso. Andes pediatr. 2024; 95(5): 525-32 . doi:https://dx.doi.org/10.32641/andespediatr.v95i5.5066